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生物信息學(xué)

出版社：科學(xué)出版社出版時(shí)間：2014-01-11
開(kāi)本： 16開(kāi) 頁(yè)數(shù)： 189
中 圖 價(jià):¥39.5(7.9折) 定價(jià)  ¥50.0 登錄后可看到會(huì)員價(jià)
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生物信息學(xué) 版權(quán)信息

生物信息學(xué) 本書(shū)特色

本書(shū)力求人各個(gè)重要的角度反映生物信息學(xué)今天的面貌：比較全面地介紹了生物信息學(xué)的若干個(gè)主要分支，并特別介紹了與人類基因組研究相關(guān)的生物信息學(xué)的一些較新的成果；著重介紹了數(shù)據(jù)庫(kù)和數(shù)據(jù)庫(kù)的查詢、序列的同源比較及其在生物進(jìn)化研究中的應(yīng)用；以生物芯片中的生物信息學(xué)問(wèn)題為例，介紹與基因表達(dá)相關(guān)的生物信息學(xué)問(wèn)題；還介紹了蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)研究中的生物信息學(xué)問(wèn)題，以及與分子設(shè)計(jì)和藥物設(shè)計(jì)相關(guān)的生物信息學(xué)技術(shù)。

生物信息學(xué) 內(nèi)容簡(jiǎn)介

書(shū)分為兩部分：一、生物信息學(xué)。主要介紹計(jì)算生物學(xué)與基因組研究，生物信息的數(shù)據(jù)庫(kù)，生物和進(jìn)化樹(shù)等。二、生物信息學(xué)相關(guān)話題；dna序列及基因表達(dá)語(yǔ)中的信息問(wèn)題，蛋白質(zhì)組研究中的信息問(wèn)題等

生物信息學(xué) 目錄

叢書(shū)序ⅰ
叢書(shū)序ⅱ
前言
**章生物信息學(xué)：導(dǎo)論
　一、什么是生物信息學(xué)？
　二、生物信息學(xué)的研究現(xiàn)狀與發(fā)展趨勢(shì)
　三、生物信息學(xué)的生物學(xué)內(nèi)涵
　　（一）基因與基因組的信息學(xué)
　。ǘ┗虮磉_(dá)的信息學(xué)：大規(guī)；蚬δ鼙磉_(dá)譜的分析
　　（三）生物大分子的三維結(jié)構(gòu)信息：蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)模擬與分子設(shè)計(jì)
　。ㄋ模┐x和疾病發(fā)生途徑的信息
　四、生物信息學(xué)的信息學(xué)內(nèi)涵
　。ㄒ唬┥镄畔(shù)據(jù)庫(kù)
　。ǘ┓治龉ぞ叩陌l(fā)展
　五、生物信息學(xué)的應(yīng)用與發(fā)展研究
　　（一）與疾病相關(guān)的基因信息及相關(guān)算法和軟件開(kāi)發(fā)
　。ǘ┙⑴c動(dòng)、植物良種繁育相關(guān)的基因組數(shù)據(jù)庫(kù)，發(fā)展分子標(biāo)記輔助育種技術(shù)
　　（三）研究與發(fā)展藥物設(shè)計(jì)軟件和基于生物信息的分子生物學(xué)技術(shù)
　六、生物信息學(xué)研究和發(fā)展中的交叉學(xué)科和大科學(xué)特點(diǎn)
　　（一）實(shí)驗(yàn)生物學(xué)家和計(jì)算生物學(xué)家
　。ǘ┤N科學(xué)文化的融合
　　（三）跨越整個(gè)生命科學(xué)的大科學(xué)
第二章分子生物信息數(shù)據(jù)庫(kù)
　一、分子生物信息數(shù)據(jù)庫(kù)簡(jiǎn)介
　　（一）基因組計(jì)劃和數(shù)據(jù)庫(kù)
　。ǘ┓肿由镄畔(shù)據(jù)庫(kù)種類
　二、基因組數(shù)據(jù)庫(kù)
　。ㄒ唬ゞdb
　　（二）acedb
　三、序列數(shù)據(jù)庫(kù)
　　（一）核酸序列數(shù)據(jù)庫(kù)
　。ǘ〆mbl和genbank數(shù)據(jù)庫(kù)格式
　　（三）常用蛋白質(zhì)序列數(shù)據(jù)庫(kù)
　。ㄋ模┢渌鞍踪|(zhì)序列數(shù)據(jù)庫(kù)
　四、結(jié)構(gòu)數(shù)據(jù)庫(kù)
　。ㄒ唬┑鞍踪|(zhì)結(jié)構(gòu)數(shù)據(jù)庫(kù)pdb
　　（二）蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)分類數(shù)據(jù)庫(kù)scop和cath
　五、二次數(shù)據(jù)庫(kù)
　。ㄒ唬┗蚪M信息二次數(shù)據(jù)庫(kù)
　。ǘ┑鞍踪|(zhì)序列二次數(shù)據(jù)庫(kù)
　。ㄈ┑鞍踪|(zhì)結(jié)構(gòu)二次數(shù)據(jù)庫(kù)
第三章數(shù)據(jù)庫(kù)查詢和數(shù)據(jù)庫(kù)搜索
　一、簡(jiǎn)介
　二、數(shù)據(jù)庫(kù)查詢系統(tǒng)entrez
　　（一）entrez系統(tǒng)使用方法
　。ǘ〆ntrez系統(tǒng)的特點(diǎn)
　三、數(shù)據(jù)庫(kù)查詢系統(tǒng)srs
　。ㄒ唬﹕rs系統(tǒng)使用方法
　　（二）srs系統(tǒng)的特點(diǎn)
　四、數(shù)據(jù)庫(kù)搜索簡(jiǎn)介
　　（一）核苷酸堿基和氨基酸殘基代碼表
　。ǘ┫嗨菩院屯葱
　　（三）局部相似性和整體相似性
　。ㄋ模┫嗨菩杂(jì)分矩陣
　五、數(shù)據(jù)庫(kù)搜索工具blast
　。ㄒ唬┏绦蚝(jiǎn)介
　。ǘ゜last程序運(yùn)行實(shí)例
第四章序列的同源比較及分子系統(tǒng)學(xué)和分子進(jìn)化分析
　一、簡(jiǎn)介
　二、相似序列的獲得
　　（一）blast
　。ǘ┡cblast相關(guān)的一些知識(shí)
　　（三）獲得同源序列的其他方法
　三、多序列比對(duì)
　四、系統(tǒng)發(fā)育分析
　。ㄒ唬┫到y(tǒng)樹(shù)的構(gòu)建方法
　　（二）常用的系統(tǒng)樹(shù)構(gòu)建程序
　。ㄈ┮恍┬枰⒁獾膯(wèn)題
　。ㄋ模ヽog數(shù)據(jù)庫(kù)
　五、其他分子標(biāo)記在生物系統(tǒng)學(xué)中的應(yīng)用
　　（一）rflp（restrictionfragmentlengthpolymorphism）標(biāo)記
　。ǘ﹑cr擴(kuò)增片段長(zhǎng)度的多樣性
　。ㄈ﹕np標(biāo)記
　。ㄋ模┩っ
第五章生物信息學(xué)與基因芯片
　一、概述
　　（一）基因芯片簡(jiǎn)介
　。ǘ┗蛐酒瑢(duì)于生物分子信息檢測(cè)的作用和意義
　　（三）基因芯片研究和應(yīng)用中所涉及到的生物信息學(xué)問(wèn)題
　一、基因芯片設(shè)計(jì)及優(yōu)化
　　（一）基因芯片設(shè)計(jì)的一般性原則
　。ǘヾna變異檢測(cè)型芯片與基因表達(dá)型芯片的設(shè)計(jì)
　。ㄈヽdna芯片與寡核苷酸芯片的設(shè)計(jì)
　。ㄋ模┕押塑账崽结樀膬(yōu)化設(shè)計(jì)
　　（五）基因芯片的優(yōu)化
　二、基于芯片的序列分析
　。ㄒ唬y(cè)定未知序列
　。ǘ┲苯訖z測(cè)目標(biāo)序列
　　（三）dna序列突變檢測(cè)分析
　。ㄋ模﹕np分析
　四、基于芯片的基因功能分析
　　（一）基因表達(dá)分析
　。ǘ└呙芏然虮磉_(dá)芯片
　。ㄈ┗虮磉_(dá)圖譜
　　（四）尋找基因功能
　五、基因芯片檢測(cè)結(jié)果的分析
　　（一）熒光檢測(cè)圖像處理
　。ǘz測(cè)結(jié)果分析
　。ㄈz測(cè)結(jié)果可靠性分析
　八、基因芯片信息的管理和利用
　　（一）基因芯片信息管理
　。ǘ⿺(shù)據(jù)集成和交叉索引
　。ㄈ⿺(shù)據(jù)的可比性和歸一化問(wèn)題
　。ㄋ模┗蛐酒畔⒌睦
　七、基于基因芯片的數(shù)據(jù)挖掘及可視化
　。ㄒ唬⿺(shù)據(jù)挖掘
　。ǘ┗蛐酒亩嘣獢(shù)據(jù)結(jié)構(gòu)
　。ㄈ⿺(shù)據(jù)相似程度的量化與距離矩陣
　　（四）聚類分析
　。ㄎ澹┚垲惙治鼋Y(jié)果的樹(shù)圖表示
　　（六）基因芯片數(shù)據(jù)的可視化和與數(shù)據(jù)庫(kù)的鏈接
　　八、基因轉(zhuǎn)錄調(diào)控網(wǎng)絡(luò)分析
　　（一）布爾網(wǎng)絡(luò)模型
　。ǘ┚性組合模型
　。ㄈ┘訖(quán)矩陣模型
　　（四）互信息關(guān)聯(lián)網(wǎng)絡(luò)
第六章蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)預(yù)測(cè)的原理與方法
　一、引言
　二、影響蛋白質(zhì)折疊的因素
　三、蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)分析及蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)數(shù)據(jù)庫(kù)
　　（一）有關(guān)氨基酸殘基的信息
　。ǘ┲芷谛缘亩(jí)結(jié)構(gòu)
　　（三）非同期性的二級(jí)結(jié)構(gòu)
　。ㄋ模埢g的相互作用及埋藏
　　（五）超二級(jí)結(jié)構(gòu)
　。┑鞍踪|(zhì)結(jié)構(gòu)數(shù)據(jù)庫(kù)
　。ㄆ撸┑鞍踪|(zhì)結(jié)構(gòu)域的折疊模式與蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)分類數(shù)據(jù)庫(kù)
　。ò耍┑鞍踪|(zhì)的進(jìn)化
　四、二級(jí)結(jié)構(gòu)預(yù)測(cè)
　。ㄒ唬┒(jí)結(jié)構(gòu)預(yù)測(cè)概況
　。ǘヽhou—fasman方法
　　（三）cor方法
　。ㄋ模*近鄰居方法
　。ㄎ澹┥窠(jīng)網(wǎng)絡(luò)方法
　。┗诙嘀匦蛄斜葘(duì)的二級(jí)結(jié)構(gòu)預(yù)測(cè)
　　（七）二級(jí)結(jié)構(gòu)預(yù)測(cè)的準(zhǔn)確度
　。ò耍┒(jí)結(jié)構(gòu)在線預(yù)測(cè)（onlineprediction）
　五、三級(jí)結(jié)構(gòu)預(yù)測(cè)
　。ㄒ唬┩吹鞍踪|(zhì)結(jié)構(gòu)預(yù)測(cè)
　。ǘ┑鞍踪|(zhì)折疊類型識(shí)別
　　（三）蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)從頭預(yù)測(cè)
　　六、蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)預(yù)測(cè)發(fā)展趨勢(shì)
第七章生物信息學(xué)與藥物設(shè)計(jì)
　一當(dāng)代生物醫(yī)藥研究所面臨的困難
　二、現(xiàn)代生物學(xué)給生物醫(yī)藥帶來(lái)的發(fā)展契機(jī)
　三、基因組學(xué)、蛋白質(zhì)組學(xué)和生物信息學(xué)在藥物研究中的應(yīng)用
　。ㄒ唬┻x擇藥物作用靶標(biāo)的標(biāo)準(zhǔn)
　。ǘ┖蜻x藥物作用靶標(biāo)的發(fā)現(xiàn)
　。ㄈ┌袠(biāo)有效性的驗(yàn)證
　。ㄋ模┧幬镒饔脵C(jī)制的研究
　。ㄎ澹┧幬锏乃幋鷦(dòng)力學(xué)及毒理性質(zhì)的研究
　四、計(jì)算機(jī)輔助藥物設(shè)計(jì)
　。ㄒ唬╅g接藥物設(shè)計(jì)
　。ǘ┲苯铀幬镌O(shè)計(jì)
　。ㄈ┧幬镌O(shè)計(jì)實(shí)例
　五、未來(lái)藥物研究方法展望
　。ㄒ唬┤祟惢蚪M和生物信息學(xué)的發(fā)展，將為藥物設(shè)計(jì)研究開(kāi)辟更廣闊的空間
　。ǘ┏(jí)計(jì)算機(jī)的發(fā)展將為復(fù)雜生物體系的理論計(jì)算和藥物設(shè)計(jì)創(chuàng)造有利的條件
　。ㄈ┯(jì)算機(jī)輔助藥物設(shè)計(jì)與組合化學(xué)技術(shù)相結(jié)合將顯示巨大威力
　。ㄋ模┗诮Y(jié)構(gòu)的藥物設(shè)計(jì)將向基于作用機(jī)制的藥物設(shè)計(jì)方向發(fā)展

 

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