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二穗短柄草中抗病基因家族的分析及機器學習預(yù)測方法研究

二穗短柄草中抗病基因家族的分析及機器學習預(yù)測方法研究

出版社：重慶大學出版社出版時間：2020-08-01
開本： 26cm 頁數(shù)： 158頁
本類榜單：自然科學銷量榜
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二穗短柄草中抗病基因家族的分析及機器學習預(yù)測方法研究 版權(quán)信息

  • ISBN：9787568921817
  • 條形碼：9787568921817 ; 978-7-5689-2181-7
  • 裝幀：暫無
  • 冊數(shù)：暫無
  • 重量：暫無
  • 所屬分類：>

二穗短柄草中抗病基因家族的分析及機器學習預(yù)測方法研究 本書特色

本文詳細分析了模式植物二穗短柄草中抗病基因家族NBS—LRR的特征，研究了怎樣從其全基因序列中鑒定抗病基因家族及各基因家族內(nèi)成員的特征，并詳細分析了這些抗病基因亞類型、結(jié)構(gòu)域、進化信息、染色體定位等眾多序列特征，然后根據(jù)這些序列特征，研究了從這些抗病基因序列中抽取離散特征向量的方法，并應(yīng)用不同的機器學習方法對NBS—LRR抗病基因家族進行模型構(gòu)建，并選擇支持向量機作為一種機器學習模型進行模型參數(shù)選擇和參數(shù)優(yōu)化方法，*后研究了應(yīng)用構(gòu)建好的預(yù)測模型對其它經(jīng)濟作物全基因組序列進行抗病基因的預(yù)測、抗病基因的注釋和分類的一站式分析平臺的構(gòu)建方法。

二穗短柄草中抗病基因家族的分析及機器學習預(yù)測方法研究 內(nèi)容簡介

本文詳細分析了模式植物二穗短柄草中抗病基因家族NBS-LRR的特征, 研究了怎樣從其全基因序列中鑒定抗病基因家族及各基因家族內(nèi)成員的特征, 并詳細分析了這些抗病基因亞類型、結(jié)構(gòu)域、進化信息、染色體定位等眾多序列特征, 然后根據(jù)這些序列特征, 研究了從這些抗病基因序列中抽取離散特征向量的方法, 并應(yīng)用不同的機器學習方法對NBS-LRR抗病基因家族進行模型構(gòu)建, 并選擇支持向量機作為一種機器學習模型進行模型參數(shù)選擇和參數(shù)優(yōu)化方法, *后研究了應(yīng)用構(gòu)建好的預(yù)測模型對其它經(jīng)濟作物全基因組序列進行抗病基因的預(yù)測、抗病基因的注釋和分類的一站式分析平臺的構(gòu)建方法。

二穗短柄草中抗病基因家族的分析及機器學習預(yù)測方法研究 目錄

1 緒論
1.1 植物抗病基因概述
1.2 植物抗病基因研究中的生物信息學
1.3 常用生物信息學數(shù)據(jù)庫和分析軟件
1.4 本書的技術(shù)線路圖
1.5 本書的主要內(nèi)容
1.6 本書的目的和意義
2 二穗短柄草抗病基因家族NBS.LRR的鑒定與生物信息學
分析
2.1 引言及研究動機
2.2 數(shù)據(jù)與方法
2.3 結(jié)果與分析
2.4 討論與小結(jié)
3 二穗短柄草NBS.LRR抗病基因家族的表達譜分析
3.1 引言及研究動機
3.2 基因表達譜分析的常用技術(shù)
3.3 實驗數(shù)據(jù)的獲取
3.4 結(jié)果與分析
3.5 討論與小結(jié)
4 NBS—LRR基因家族預(yù)測算法的設(shè)計與應(yīng)用
4.1 研究背景
4.2 方法與數(shù)據(jù)集
4.3 結(jié)果與分析
5 總結(jié)與展望
5.1 主要研究結(jié)果
5.2 創(chuàng)新點
5.3 展望
附錄
附錄l 縮略詞簡表
附錄2 NBS—LRR抗病基因列表
附錄3 二穗短柄草中我們鑒定出的126個典型的NBS—LRR抗病基因的蛋白序列
附錄4 NBS一LRR抗病基因的基因簇分布
附錄5 氨基酸的部分理化性質(zhì)簡表
附錄6 擬南芥中的正負樣本序列列表
附錄7 NBS—LRR抗病基因的蛋白序列結(jié)構(gòu)域特征
參考文獻
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