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表觀遺傳學(xué)(原書第2版)

作者:C.D.阿利斯
出版社:科學(xué)出版社出版時間:2023-07-01
開本: 16開 頁數(shù): 820
中 圖 價:¥435.0(7.5折) 定價  ¥580.0 登錄后可看到會員價
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表觀遺傳學(xué)(原書第2版) 版權(quán)信息

表觀遺傳學(xué)(原書第2版) 內(nèi)容簡介

表觀遺傳作為與基因組序列無關(guān)的基因組功能調(diào)控重要途徑,是后基因組時代生命科學(xué)的研究熱點(diǎn)。本書內(nèi)容包括表觀遺傳學(xué)概念的歷史演變、組蛋白的進(jìn)化、DNA 和組蛋白修飾的寫入器/擦除器/閱讀器的種 類/功能/結(jié)構(gòu)、組蛋白變體的種類/結(jié)構(gòu)/功能、多梳蛋白和 Trithorax 家族蛋白的功能、核小體重塑復(fù)合體組成和功能、非編碼 RNA 種類/生物合成/功能、三維基因組學(xué)的研究方法與功能,以及不同生物體包括動物、植物、酵母、脈胞菌、纖毛蟲、線蟲、果蠅的表觀遺傳學(xué)及特殊組織細(xì)胞包括多能干細(xì)胞、免疫細(xì)胞、癌細(xì)胞的表觀遺傳學(xué)。本書既可以作為表觀遺傳學(xué)領(lǐng)域的入門讀物,又可以作為遺傳學(xué)相關(guān)專業(yè)科研人員的理論基礎(chǔ)讀物。另外,本書還適合作為本科生和研究生的教學(xué)參考書。

表觀遺傳學(xué)(原書第2版) 目錄

目錄第1章 表觀遺傳學(xué)簡史 11.1 引言 11.2 來自遺傳學(xué)和發(fā)育生物學(xué)的線索 21.3 DNA在一個生物體的所有體細(xì)胞中都是相同的 31.4 DNA甲基化的作用 41.5 染色質(zhì)的作用 41.6 所有機(jī)制都是相互關(guān)聯(lián)的 7致謝 7第2章 下一代:年輕科學(xué)家在表觀遺傳學(xué)研究中令人振奮的新發(fā)現(xiàn) 82.1 組蛋白去甲基化酶的發(fā)現(xiàn) 102.2 細(xì)胞重編程 122.3 lncRNA:將RNA與染色質(zhì)相連接 142.4 增強(qiáng)子RNA:一類在增強(qiáng)子處合成的長鏈非編碼RNA 16致謝 182.5 表觀遺傳學(xué)拓展:基因組DNA中胞嘧啶的新修飾 182.6 植物可移動小RNA 212.7 CpG島染色質(zhì)是通過CxxC類鋅指蛋白的招募而形成的 242.8 用于癌癥治療的布羅莫結(jié)構(gòu)域和超末端結(jié)構(gòu)域抑制劑:染色質(zhì)結(jié)構(gòu)的化學(xué)調(diào)節(jié) 262.9 含布羅莫結(jié)構(gòu)域蛋白在炎癥反應(yīng)中的藥理抑制作用 282.10 兒童腦瘤中的組蛋白H3突變 312.11 染色體折疊是表觀遺傳狀態(tài)的“駕駛員”還是“乘客”? 33致謝 35第3章 概述和概念 363.1 遺傳學(xué)與表觀遺傳學(xué) 383.2 研究表觀遺傳學(xué)的模型系統(tǒng) 403.3 表觀遺傳學(xué)的定義 423.4 染色質(zhì)模板 443.5 組蛋白修飾:寫入器和擦除器 443.6 組蛋白閱讀器和染色質(zhì)重塑因子 483.7 組蛋白變體 493.8 組蛋白修飾的生物學(xué)效應(yīng) 503.9 染色質(zhì)的高階組織 553.10 DNA甲基化 583.11 RNAi和RNA介導(dǎo)的基因沉默 603.12 常染色質(zhì)與異染色質(zhì)的區(qū)別 623.13 從單細(xì)胞到多細(xì)胞系統(tǒng) 653.14 表觀基因組參考圖 663.15 擴(kuò)展的基因概念和非編碼RNA 693.16 Polycomb和Trithorax 713.17 X染色體失活和兼性異染色質(zhì) 753.18 細(xì)胞命運(yùn)重編程 773.19 癌癥和表觀遺傳治療 793.20 人類疾病的表觀遺傳因素 813.21 代謝和環(huán)境的表觀遺傳應(yīng)答 843.22 表觀遺傳的遺傳 873.23 表觀遺傳調(diào)控到底有什么功能? 903.24 表觀遺傳研究中涉及的重大問題 91網(wǎng)絡(luò)資源 93第4章 組蛋白乙;膶懭肫骱烷喿x器:結(jié)構(gòu)、機(jī)制和抑制 944.1 組蛋白的寫入器、擦除器和閱讀器介紹 954.2 組蛋白乙酰轉(zhuǎn)移酶 964.3 乙酰賴氨酸閱讀器 1064.4 展望 114致謝 114第5章 組蛋白乙;脸鳎航M蛋白去乙; 1155.1 引言 1165.2 HDAC家族和分類:2個家族和4個類別 1175.3 催化機(jī)理和結(jié)構(gòu) 1205.4 HDAC的底物 1245.5 HDAC活性的調(diào)節(jié) 1265.6 HDAC的生物學(xué)重要性 1295.7 抑制劑 1325.8 總結(jié) 137第6章 DNA和組蛋白甲基化的結(jié)構(gòu)和功能協(xié)調(diào) 1386.1 組蛋白甲基化和去甲基化 1396.2DNA甲基化 1476.3 DNA甲基化與組蛋白修飾之間的相互作用 1506.4 總結(jié) 155致謝 156第7章 組蛋白表觀遺傳標(biāo)記和DNA甲基化標(biāo)記讀取的結(jié)構(gòu)解析 1577.1 引言 1587.2 通過PHD指和BAH模塊讀取Kme標(biāo)記 1617.3 通過單個Royal家族模塊讀取Kme標(biāo)記1657.4 通過串聯(lián)Royal家族模塊讀取Kme標(biāo)記1677.5 通過組合和配對模塊讀取Kme標(biāo)記 1717.6 通過Tudor模塊讀取甲基化精氨酸標(biāo)記 1737.7 未修飾賴氨酸標(biāo)記的讀取 1757.8 未修飾精氨酸標(biāo)記的讀取 1767.9 肽水平上通過連鎖結(jié)合模塊的多價讀取1787.10 核小體水平通過連鎖結(jié)合模塊的多價讀取 1827.11 PHD-bromo盒的非染色質(zhì)功能角色 1827.12 組蛋白標(biāo)記間的互作 1837.13 組蛋白類似物 1867.14 DNA上全甲基化5mCpG位點(diǎn)的讀取 1877.15 DNA上半甲基化5mCpG位點(diǎn)的讀取 1907.16 展望與未來挑戰(zhàn) 192致謝 198第8章 釀酒酵母的表觀遺傳學(xué) 1998.1 酵母的遺傳和分子工具 2008.2 酵母的生命周期 2038.3 酵母異染色質(zhì)存在于沉默的HM交配位點(diǎn)和端粒之中 2058.4 Sir蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)與進(jìn)化保守性 2068.5 沉默染色質(zhì)是一種在整個結(jié)構(gòu)域中擴(kuò)散的抑制性結(jié)構(gòu)2088.6 異染色質(zhì)組裝的不同步驟 2098.7 組蛋白H4K16乙;捌浔 Sir2 去乙;年P(guān)鍵作用 2128.8 屏障功能:組蛋白修飾限制Sir復(fù)合體擴(kuò)散2138.9 H3氨基末端尾巴在高階染色質(zhì)結(jié)構(gòu)中的作用 2148.10 端粒的反式相互作用和異染色質(zhì)的核周緣附著 2158.11 端粒環(huán)化 2178.12 天然亞端粒結(jié)構(gòu)域的可變抑制 2178.13 表觀遺傳狀態(tài)的遺傳 2188.14 Sir蛋白和沉默染色質(zhì)的其他功能 2198.15 總結(jié) 222第9章 粟酒裂殖酵母染色質(zhì)狀態(tài)的表觀調(diào)控 2239.1 粟酒裂殖酵母的生命周期 2249.2 異染色質(zhì)組分的篩選 2269.3 不同類型的異染色質(zhì) 2279.4 粟酒裂殖酵母的著絲粒:研究異染色質(zhì)的范例2289.5 粟酒裂殖酵母著絲粒染色質(zhì)結(jié)構(gòu)域和動粒2349.6 其他沉默區(qū)的異染色質(zhì)形成 2389.7 粟酒裂殖酵母的核小體重塑 2409.8 粟酒裂殖酵母的細(xì)胞核裝配 2409.9 粟酒裂殖酵母的基因組和表觀基因組2429.10 總結(jié) 243致謝 243第10章 粗糙脈孢菌:一個用于表觀遺傳學(xué)研究的模型系統(tǒng) 24410.1 粗糙脈孢菌:有機(jī)體的歷史和特征 24510.2 脈孢菌DNA甲基化 24710.3 RIP—一個同時具有遺傳和表觀遺傳學(xué)方面的基因組防御系統(tǒng) 24910.4 對RIP遺留痕跡的研究為DNA甲基化的調(diào)控提供了見解 24910.5 組蛋白H3K27甲基化 25310.6 抑制 25310.7 減數(shù)分裂沉默 25510.8 RIP、抑制和減數(shù)分裂沉默的可能功能和實(shí)際用途 25810.9 總結(jié) 259致謝 259第11章 纖毛蟲的表觀遺傳學(xué) 26011.1 纖毛蟲:具有兩個不同基因組的單細(xì)胞 26211.2 接合:生殖系和體細(xì)胞基因組的分化 26311.3 大核和微核:活性與沉默染色質(zhì)的模型 26311.4 纖毛蟲中同源依賴的基因沉默 26511.5 大核發(fā)育過程中的全基因組重排 26611.6 DNA消除是由同源依賴機(jī)制介導(dǎo)的 26911.7 DNA消除是由小RNA介導(dǎo)的整個基因組跨核比較引導(dǎo)的 27311.8 scnRNA誘導(dǎo)的異染色質(zhì)形成先于DNA消除 27511.9DNA有序化以母體RNA為模板 27611.10 程序化基因組重排的生物學(xué)功能 27811.11 交配型決定的表觀遺傳調(diào)控 27911.12 總結(jié) 280第12章 果蠅的花斑型位置效應(yīng)、異染色質(zhì)形成和基因沉默 28112.1 基因異常地與異染色質(zhì)靠近顯示出花斑表型 28212.2 篩選PEV抑制劑和增強(qiáng)子以鑒定出染色體蛋白質(zhì)和染色體蛋白質(zhì)修飾因子 28612.3 染色體蛋白質(zhì)的分布和結(jié)合模式 28912.4 組蛋白修飾在異染色質(zhì)沉默中起關(guān)鍵作用 29012.5 染色體蛋白質(zhì)形成相互依賴的復(fù)合體來維持和擴(kuò)展異染色質(zhì)結(jié)構(gòu) 29212.6 并非所有異染色質(zhì)都是相同的:空間組織很重要 29612.7 果蠅異染色質(zhì)的形成是如何靶向的? 29912.8 不同生物體中的PEV、異染色質(zhì)形成與基因沉默 30012.9 總結(jié):關(guān)于異染色質(zhì),我們還有很多未知 301致謝 302第13章 植物的表觀遺傳調(diào)控 30313.1 植物作為表觀遺傳研究的模型 30413.2 植物中染色質(zhì)的分子組成 31213.3 RNA介導(dǎo)的基因沉默途徑的分子成分 31913.4 展望 329致謝 330第14章 利用小鼠模型研究表觀遺傳學(xué) 33114.1 利用小鼠模型鑒定表觀遺傳重編程修飾因子 33214.2 近交小鼠克隆中的表觀遺傳現(xiàn)象 34414.3 總結(jié)與展望 352第15章 哺乳動物中的DNA甲基化 35415.1 細(xì)胞記憶的機(jī)制 35515.2 DNA甲基化模式的建立 35715.3 DNA去甲基化 36115.4 DNA甲基化調(diào)控基因表達(dá) 36415.5 DNA甲基化與組蛋白修飾的相互作用 36715.6 DNA甲基化與疾病 36815.7 展望 370致謝 372第16章 RNAi和異染色質(zhì)組裝 37316.1 RNAi途徑概述 37416.2 表明RNA是TGS中介的早期證據(jù) 37716.3 粟酒裂殖酵母中RNAi和異染色質(zhì)組裝 37816.4 擬南芥中RNAi介導(dǎo)的染色質(zhì)和 DNA修飾 38416.5 動物中RNAi介導(dǎo)的染色質(zhì)修飾的保守性 38616.6 總結(jié) 387第17章 多梳蛋白家族介導(dǎo)的轉(zhuǎn)錄沉默 38917.1 引言 39017.2 染色質(zhì)上沉默標(biāo)記的建立 39317.3 PcG復(fù)合體靶向到沉默的基因 40217.4 發(fā)育和疾病中的PcG抑制 40517.5 總結(jié)與展望 409致謝 410第18章 一組Trithorax蛋白質(zhì)調(diào)控基因表達(dá) 41118.1 引言 41218.2 trxG蛋白與染色質(zhì)的聯(lián)系 41618.3 trxG蛋白與一般轉(zhuǎn)錄機(jī)制的聯(lián)系 42218.4 trxG蛋白與黏連蛋白的聯(lián)系 42318.5 其他trxG蛋白的生化功能 42318.6 trxG蛋白和PcG蛋白的功能互作 42318.7 非編碼RNA和trxG蛋白 42418.8 trxG蛋白和人類疾病 42518.9 總結(jié) 425第19章 染色質(zhì)的遠(yuǎn)程交互作用 42619.1 引言:體內(nèi)儲存DNA的挑戰(zhàn) 42819.2 核架構(gòu)背景下的遠(yuǎn)程交互作用 42919.3 染色質(zhì)交互作用和基因調(diào)控的分析 43519.4 染色質(zhì)環(huán)交互的不同類型 43819.5 構(gòu)建染色質(zhì)環(huán) 44319.6 環(huán)的交互和基因調(diào)控 44419.7 總結(jié) 444第20章 組蛋白變體和表觀遺傳學(xué) 44620.1 所有生物中DNA被結(jié)構(gòu)性蛋白包裝 44720.2 真核生物核心組蛋白從古細(xì)菌組蛋白進(jìn)化而來 44920.3 大量組蛋白在DNA復(fù)制后加載 45120.4 組蛋白變體在整個細(xì)胞周期中加載 45220.5 一種特殊的組蛋白H3變體標(biāo)記了著絲粒 45220.6 組蛋白變體H3.3的替換發(fā)生在活躍染色質(zhì)上 45620.7 H3.3在生殖系中的功能 45720.8 H2A.X的磷酸化在DNA雙鏈斷裂修復(fù)過程中的功能45920.9 H2A.Z在染色質(zhì)調(diào)節(jié)中起多種作用 46020.10 H3.3和H2A.Z占據(jù)特定染色質(zhì)位置 46120.11 H2A.Z核小體的占據(jù)是動態(tài)的并改變?nèi)旧|(zhì)的特性 46220.12 H2A.Z在表觀繼承中的功能 46320.13 其他H2A變體區(qū)分染色質(zhì),但它們的功能尚不清楚 46420.14 許多組蛋白已經(jīng)進(jìn)化,以更緊密地包裝DNA 46520.15 組蛋白變體與人類疾病 46620.16 總結(jié)與展望 467第21章 核小體重塑與表觀遺傳學(xué) 46821.1 核小體重塑的發(fā)現(xiàn):歷史回顧 47021.2 核小體重塑的具體細(xì)節(jié) 47321.3 核小體重塑復(fù)合體的多樣性 47621.4 核小體重塑因子作為轉(zhuǎn)錄調(diào)控因子 47821.5 染色質(zhì)組裝與組織過程中的核小體重塑 48021.6 染色質(zhì)重塑因子對組蛋白修飾的識別 48121.7 翻譯后修飾對重塑因子的調(diào)控 48221.8 染色質(zhì)重塑因子與DNA甲基化的相互作用 48321.9 染色質(zhì)重塑因子和組蛋白變體 48321.10 發(fā)
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